34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3051 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3051  protein of unknown function DUF1528  100 
 
 		 478 aa  993    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  35.27 
 
 		 485 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  27.76 
 
 		 560 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  38.17 
 
 		 398 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  33.68 
 
 		 570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  37.85 
 
 		 569 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  28.74 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  31.47 
 
 		 599 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  29.28 
 
 		 640 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 575 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  34.91 
 
 		 595 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  34.69 
 
 		 593 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  34.17 
 
 		 615 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  30.32 
 
 		 642 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  30.71 
 
 		 569 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  29.26 
 
 		 634 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  29.35 
 
 		 318 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  32.89 
 
 		 615 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  33.93 
 
 		 627 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  33.04 
 
 		 617 aa  80.9  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  31.95 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  33.65 
 
 		 615 aa  76.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  31.72 
 
 		 612 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  31.95 
 
 		 616 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  36.75 
 
 		 623 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  29.73 
 
 		 639 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  32.44 
 
 		 621 aa  73.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  29.28 
 
 		 643 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  34.93 
 
 		 680 aa  73.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  37.5 
 
 		 660 aa  72  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  31.75 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  28.75 
 
 		 639 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  24.79 
 
 		 624 aa  53.5  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  26.52 
 
 		 611 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>