28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1880 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  65.31 
 
 		 815 aa  1088    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  52.36 
 
 		 846 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  65.75 
 
 		 820 aa  1105    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  78.55 
 
 		 844 aa  1350    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2284  hypothetical protein  54.57 
 
 		 674 aa  742    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.869648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1952  putative virulence factor  54.43 
 
 		 679 aa  741    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  100 
 
 		 832 aa  1708    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1433  putative virulence factor  37.18 
 
 		 743 aa  475  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  44.68 
 
 		 888 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  44.31 
 
 		 881 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  32.88 
 
 		 893 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  40.84 
 
 		 910 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  39.17 
 
 		 899 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  29.83 
 
 		 726 aa  305  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  39.17 
 
 		 899 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  30.88 
 
 		 714 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  30.51 
 
 		 714 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  30.64 
 
 		 714 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  30.51 
 
 		 714 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  30.64 
 
 		 714 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  30.2 
 
 		 901 aa  185  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  29.66 
 
 		 890 aa  183  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  32.53 
 
 		 862 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  29.06 
 
 		 878 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  28 
 
 		 892 aa  173  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  46.47 
 
 		 185 aa  148  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  27.32 
 
 		 835 aa  115  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  23.58 
 
 		 938 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>