45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1220 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  100 
 
 
330 aa  676    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  90.85 
 
 
329 aa  611  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  63.53 
 
 
332 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  62.31 
 
 
333 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  61.7 
 
 
331 aa  423  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  62.61 
 
 
333 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  62.31 
 
 
333 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  60.79 
 
 
333 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  60.49 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  56.06 
 
 
337 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  55.76 
 
 
340 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  56.67 
 
 
340 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  59.21 
 
 
335 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  55.45 
 
 
336 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  55.15 
 
 
336 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  51.67 
 
 
359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  56.33 
 
 
340 aa  362  7.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  54.38 
 
 
335 aa  361  8e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  55.15 
 
 
336 aa  361  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  49.85 
 
 
333 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  53.47 
 
 
335 aa  342  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  52.27 
 
 
334 aa  341  9e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  51.06 
 
 
340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  49.54 
 
 
346 aa  334  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  49.85 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  35.45 
 
 
337 aa  186  6e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  41.11 
 
 
363 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  40.73 
 
 
337 aa  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  34.23 
 
 
340 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  38.69 
 
 
348 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  36.78 
 
 
341 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  37.72 
 
 
348 aa  156  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  37.29 
 
 
348 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  34.17 
 
 
353 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  35.41 
 
 
343 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  35.27 
 
 
338 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  35.53 
 
 
338 aa  146  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  32.08 
 
 
365 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  34.43 
 
 
343 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  34.8 
 
 
348 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  36.55 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  34.8 
 
 
349 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  32.97 
 
 
392 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  28.41 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  28.1 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>