45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3968 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  100 
 
 
335 aa  685    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  92.54 
 
 
335 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  58.23 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  56.76 
 
 
334 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  54.38 
 
 
333 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  52.27 
 
 
359 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  54.05 
 
 
340 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  55.35 
 
 
340 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  54.04 
 
 
332 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  54.38 
 
 
330 aa  361  8e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  53.68 
 
 
329 aa  358  8e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  52.91 
 
 
337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  56.12 
 
 
335 aa  350  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  50.93 
 
 
333 aa  344  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  51.36 
 
 
331 aa  339  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  52.13 
 
 
340 aa  337  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  52.91 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  52.29 
 
 
336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  51.99 
 
 
336 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  50.93 
 
 
333 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  50.93 
 
 
333 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  50 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  50 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  47.68 
 
 
346 aa  311  9e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  48.29 
 
 
348 aa  292  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  43.93 
 
 
337 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  40.57 
 
 
348 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  38.27 
 
 
348 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  39.43 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  33.97 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  42.59 
 
 
363 aa  168  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  37.37 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  35.08 
 
 
343 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  37.99 
 
 
340 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  37.22 
 
 
341 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  34.75 
 
 
343 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  36.96 
 
 
348 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  36.36 
 
 
360 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  32.74 
 
 
365 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  36.45 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  36.45 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  28.11 
 
 
353 aa  123  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  31.5 
 
 
354 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  30.69 
 
 
392 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  28.52 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>