13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3730 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3730    100 
 
 
250 bp  496  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  91.94 
 
 
1041 bp  83.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0914    91.94 
 
 
2410 bp  83.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  91.94 
 
 
1041 bp  83.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  91.94 
 
 
1041 bp  83.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  91.94 
 
 
1041 bp  83.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  88.64 
 
 
1041 bp  48.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  88.64 
 
 
1041 bp  48.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  88.64 
 
 
1041 bp  48.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  88.64 
 
 
1041 bp  48.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  88.64 
 
 
1041 bp  48.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  91.67 
 
 
1041 bp  48.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3895  iSSod13, transposase  85.71 
 
 
192 bp  48.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>