28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2100 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  62.15 
 
 
815 aa  1046    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1952  putative virulence factor  52.41 
 
 
679 aa  720    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2284  hypothetical protein  52.75 
 
 
674 aa  721    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.869648 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  78.67 
 
 
832 aa  1363    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  100 
 
 
844 aa  1727    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  51.55 
 
 
846 aa  869    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  63.21 
 
 
820 aa  1065    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1433  putative virulence factor  35.7 
 
 
743 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  43.33 
 
 
888 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  42.75 
 
 
881 aa  373  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  40.08 
 
 
910 aa  340  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  29.96 
 
 
726 aa  318  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  30.63 
 
 
714 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  30.14 
 
 
714 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  30.14 
 
 
714 aa  302  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  30.14 
 
 
714 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  30.01 
 
 
714 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  37.55 
 
 
899 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  37.76 
 
 
899 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  37.5 
 
 
893 aa  283  9e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  30.24 
 
 
901 aa  185  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  30.83 
 
 
890 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  29.58 
 
 
878 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  30.62 
 
 
862 aa  170  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  27.85 
 
 
892 aa  163  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  48 
 
 
185 aa  158  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  25.5 
 
 
938 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  25.99 
 
 
835 aa  90.1  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.933423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>