16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1262 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1262  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 
254 aa  531  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4657  hypothetical protein  62.99 
 
 
249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1137  hypothetical protein  60.24 
 
 
251 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.290114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1320  hypothetical protein  58.27 
 
 
250 aa  305  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0839  hypothetical protein  56.05 
 
 
244 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0800  hypothetical protein  55.06 
 
 
250 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0824  hypothetical protein  55.06 
 
 
244 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131616  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4386  hypothetical protein  52.63 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1855  hypothetical protein  38.1 
 
 
268 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5497  protein of unknown function UPF0153  38.59 
 
 
262 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.30539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4406  hypothetical protein  32.95 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6825  hypothetical protein  35.88 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3943  hypothetical protein  35.25 
 
 
263 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309645  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4987  hypothetical protein  31.68 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5135  protein of unknown function UPF0153  35.77 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425461  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  29.23 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>