25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1330 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  100 
 
 		 540 aa  1119    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0860  NERD domain protein  36.39 
 
 		 563 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  35.71 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  32.75 
 
 		 255 aa  66.6  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  29.96 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  36.36 
 
 		 304 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  30.73 
 
 		 298 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  29.32 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  30.73 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  29.32 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  39.47 
 
 		 331 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3140  hypothetical protein  31.29 
 
 		 300 aa  57  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  40 
 
 		 308 aa  57  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  41.89 
 
 		 212 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  37.93 
 
 		 310 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  33.09 
 
 		 263 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  29.25 
 
 		 256 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1095  NERD domain-containing protein  26.88 
 
 		 254 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00991797  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  37.97 
 
 		 321 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  33.33 
 
 		 261 aa  47.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  44.83 
 
 		 263 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0268  NERD domain protein  37.25 
 
 		 314 aa  47  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0422  hypothetical protein  58.62 
 
 		 153 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0045  hypothetical protein  39.66 
 
 		 96 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0264  hypothetical protein  37.88 
 
 		 313 aa  43.9  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.8207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>