30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0723 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  447  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.02 
 
 
213 aa  164  9e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.6 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.47 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.17 
 
 
213 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  42.29 
 
 
212 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.38 
 
 
231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.95 
 
 
206 aa  109  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.38 
 
 
217 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  35.42 
 
 
207 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  33.68 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  30.29 
 
 
198 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  32.23 
 
 
198 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  34.57 
 
 
233 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
197 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  59.49 
 
 
150 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  64.06 
 
 
147 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  30.3 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.88 
 
 
145 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  29.1 
 
 
181 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.24 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  53.85 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  30.69 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.01 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  35.29 
 
 
158 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  35.29 
 
 
158 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  38.67 
 
 
158 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.854792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2651  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.93 
 
 
451 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12619  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  36.11 
 
 
451 aa  42  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.93 
 
 
451 aa  42  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0356539  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>