17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3030 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3030  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.299577  normal  0.851885 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1054  hypothetical protein  64.06 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1577  hypothetical protein  65.62 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4240  hypothetical protein  63.49 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0008  hypothetical protein  62.5 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2604  hypothetical protein  66.67 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2565  hypothetical protein  64.06 
 
 		 70 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382416  normal  0.0961796 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0231  hypothetical protein  42.19 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2673  hypothetical protein  43.48 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12560  hypothetical protein  44.07 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1143  hypothetical protein  44.07 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4940  hypothetical protein  56.52 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09950  hypothetical protein  47.83 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.698592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4831  hypothetical protein  56.52 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4653  hypothetical protein  56.52 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4777  hypothetical protein  56.52 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.927704  hitchhiker  0.00369137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0643  hypothetical protein  52.17 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>