55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1923 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1923  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  187  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3645  hypothetical protein  65.91 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4850  hypothetical protein  68.29 
 
 
90 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0939  hypothetical protein  60.67 
 
 
89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398854  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0978  hypothetical protein  58.43 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0499  hypothetical protein  58.43 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2420  hypothetical protein  59.04 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0761064  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0838  hypothetical protein  59.04 
 
 
124 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118101  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3319  hypothetical protein  58.82 
 
 
87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.493809  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0850  hypothetical protein  58.62 
 
 
88 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163545  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4081  hypothetical protein  57.83 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40971  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1564  hypothetical protein  51.69 
 
 
103 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1987  hypothetical protein  52.44 
 
 
103 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3039  hypothetical protein  52.44 
 
 
103 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2987  hypothetical protein  52.44 
 
 
103 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0793  hypothetical protein  52.44 
 
 
103 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2625  hypothetical protein  52.44 
 
 
103 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3073  hypothetical protein  52.44 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2119  hypothetical protein  52.44 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0325664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3643  hypothetical protein  55.42 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0278  hypothetical protein  42.42 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0596635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4895  hypothetical protein  32.39 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0311  hypothetical protein  30.56 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  decreased coverage  0.00561451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0291  hypothetical protein  30.56 
 
 
86 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2026  hypothetical protein  31.82 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1901  hypothetical protein  40.3 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0710  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4917  hypothetical protein  29.17 
 
 
86 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  hitchhiker  0.00139076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0316  hypothetical protein  28.99 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5336  hypothetical protein  28.17 
 
 
86 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0325  hypothetical protein  29.58 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2829  hypothetical protein  41.56 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493287  normal  0.100972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4266  hypothetical protein  35.94 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0504269  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2568  hypothetical protein  40.79 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5877  hypothetical protein  30.99 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02128  hypothetical protein  36.62 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.555122  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000196  hypothetical protein  35.48 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000484737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2302  hypothetical protein  34.25 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05926  hypothetical protein  31.08 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67900  hypothetical protein  29.58 
 
 
86 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525665  normal  0.0342115 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1938  hypothetical protein  33.87 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3322  hypothetical protein  30.14 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04610  hypothetical protein  31.75 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1233  hypothetical protein  34.92 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.9486  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4254  hypothetical protein  26.39 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1573  hypothetical protein  30.14 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330992  normal  0.269924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3744  hypothetical protein  30.14 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3339  hypothetical protein  30.14 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3669  hypothetical protein  30.14 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3647  hypothetical protein  30.14 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3697  hypothetical protein  30.14 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.514391  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2082  hypothetical protein  42.22 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.106415  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3388  hypothetical protein  30.14 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.032209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3427  hypothetical protein  30.14 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3665  hypothetical protein  30.14 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>