18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1781 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  773    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  55.03 
 
 
439 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  51.04 
 
 
557 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  52.56 
 
 
440 aa  381  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  51.04 
 
 
583 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  49.1 
 
 
455 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  51.32 
 
 
451 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  51.44 
 
 
424 aa  345  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  45.31 
 
 
429 aa  322  8e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3032  hypothetical protein  39.78 
 
 
373 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31543e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3263  hypothetical protein  37.07 
 
 
381 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.521841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2693  hypothetical protein  28.13 
 
 
405 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.658833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  26.09 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  26.88 
 
 
465 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  26.58 
 
 
465 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  27.31 
 
 
454 aa  59.7  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  25.3 
 
 
457 aa  57.4  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  25 
 
 
453 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>