More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0815 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
329 aa  661    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  46.54 
 
 
320 aa  278  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  46.54 
 
 
320 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  46.54 
 
 
320 aa  278  9e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  46.54 
 
 
320 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  46.54 
 
 
320 aa  278  9e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  46.54 
 
 
320 aa  278  9e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  46.54 
 
 
320 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  46.54 
 
 
324 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  46.86 
 
 
324 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  46.23 
 
 
320 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  46.54 
 
 
324 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  47.21 
 
 
324 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  45.91 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  47.21 
 
 
324 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  44.51 
 
 
321 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  46.01 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  45.77 
 
 
322 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  45.14 
 
 
322 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  45.91 
 
 
322 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  47.77 
 
 
319 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  47.77 
 
 
319 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  47.45 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  46.54 
 
 
322 aa  242  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  45.33 
 
 
304 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 
329 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  41.45 
 
 
336 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  42.76 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
336 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  42.24 
 
 
336 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  45.7 
 
 
304 aa  219  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  44.63 
 
 
323 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  43.89 
 
 
332 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  44.63 
 
 
323 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 
369 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  44.3 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  43.56 
 
 
354 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
326 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
326 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
326 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
326 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
326 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
326 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 
302 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  41 
 
 
308 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  43.89 
 
 
332 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
324 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
324 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  44.59 
 
 
301 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  44.92 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  42.05 
 
 
301 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  41.83 
 
 
354 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  39.14 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 
318 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  40.6 
 
 
301 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  38.49 
 
 
309 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 
307 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  31.71 
 
 
333 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  29.67 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  29.49 
 
 
328 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  29.67 
 
 
333 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  31.62 
 
 
331 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  27.24 
 
 
333 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 
346 aa  99.8  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  29.49 
 
 
334 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  29.91 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  29.91 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  30.04 
 
 
332 aa  96.3  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  28.19 
 
 
331 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2176  Glycosyl transferase, family 3-like protein  30.47 
 
 
373 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.261801  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  27.71 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  28.39 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  27.97 
 
 
317 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  31.38 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  26.32 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  27.12 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  29.34 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  27.12 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  29.77 
 
 
491 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0270  anthranilate phosphoribosyltransferase-like protein  28.52 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  26.7 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3885  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.76 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1598  hypothetical protein  27.54 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4534  hypothetical protein  27.23 
 
 
359 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2001  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.77 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1189  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0318107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1680  hypothetical protein  24.1 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.99598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5395  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3100  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0711  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.31 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0993387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10650  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.92 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.156426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>