28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5158 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5158  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2652  hypothetical protein  75.32 
 
 		 78 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5523  addiction module antidote family protein  75.32 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6479  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  67.12 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3568  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 77 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.951393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2938  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  68.18 
 
 		 76 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2127  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  78.38 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114302  normal  0.153 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6276  hypothetical protein  67.65 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089402  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0726  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  37.66 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02722  hypothetical protein  50.91 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1324  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.179973 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  52.38 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  54.76 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  54.76 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5298  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  54.76 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01196  helix-turn-helix protein, CopG  45 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2400  hypothetical protein  43.1 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.976103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3206  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.78 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0460524 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  53.85 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3749  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  46.15 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359793  normal  0.747078 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5270  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.62 
 
 		 85 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2745  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.92 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>