14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3219 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3219  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  553  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.242742  normal  0.443173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3851  hypothetical protein  48.06 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0385254  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3218  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.420496 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2433  hypothetical protein  44.33 
 
 		 558 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6989  hypothetical protein  40.21 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4096  hypothetical protein  41.67 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7128  hypothetical protein  35.45 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2279  hypothetical protein  36.67 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00172266  hitchhiker  0.0000000130114 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3412  hypothetical protein  36.04 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3394  hypothetical protein  30.2 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000160878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6269  hypothetical protein  32.99 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2118  hypothetical protein  35.42 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2466  hypothetical protein  31.18 
 
 		 360 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00527701  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1001  hypothetical protein  26.88 
 
 		 394 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>