14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2466 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2466  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  748    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00527701  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1376  hypothetical protein  42.86 
 
 		 269 aa  98.6  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00857938  hitchhiker  0.00000000000221193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2326  hypothetical protein  38.89 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1001  hypothetical protein  40 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6989  hypothetical protein  35.85 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3394  hypothetical protein  30.56 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000160878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02930  hypothetical protein  42.62 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000699255  hitchhiker  4.4397000000000005e-45 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2433  hypothetical protein  31.58 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6269  hypothetical protein  27.62 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3219  hypothetical protein  31.18 
 
 		 266 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.242742  normal  0.443173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4096  hypothetical protein  28.97 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3851  hypothetical protein  28.7 
 
 		 285 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0385254  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2118  hypothetical protein  27.68 
 
 		 287 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1335  hypothetical protein  23.08 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>