37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2087 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2087  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  805    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0716956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3931  hypothetical protein  58.33 
 
 		 398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4197  hypothetical protein  57.81 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1002  hypothetical protein  50.13 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5885  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  49.74 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1216  signal peptide prediction  46.37 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3722  signal peptide prediction  44.65 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2912  signal peptide prediction  45.1 
 
 		 423 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.511961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01580  signal peptide prediction  44.85 
 
 		 427 aa  352  7e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3337  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic binding protein  36.76 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.874781  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4063  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic binding protein  36.5 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.797968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3636  hypothetical protein  36.1 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2472  twin-arginine translocation pathway signal  38.06 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6278  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  35.06 
 
 		 429 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2919  putative spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  36.62 
 
 		 432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2658  putative spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  36.1 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5902  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  35.84 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5257  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  35.58 
 
 		 431 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.726657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1010  twin-arginine translocation pathway signal  36.48 
 
 		 431 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617003  hitchhiker  0.00435801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3534  twin-arginine translocation pathway signal  36.48 
 
 		 422 aa  282  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1361  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  35.32 
 
 		 431 aa  279  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.721333  normal  0.0486797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3374  ABC transporter substrate-binding protein  35.7 
 
 		 415 aa  276  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3269  twin-arginine translocation pathway signal  35.17 
 
 		 429 aa  275  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3943  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  35.06 
 
 		 420 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627454  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0101  ABC transporter substrate-binding protein  35.06 
 
 		 427 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0635162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2893  putative ABC transporter substrate-binding protein  34.02 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4739  ABC transporter substrate-binding protein  34.03 
 
 		 426 aa  262  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0208  twin-arginine translocation pathway signal  33.59 
 
 		 435 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0825185 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7129  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  32.65 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1905  putative ABC transporter substrate-binding protein  32.82 
 
 		 421 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0997  putative substrate-binding component of ABC transporter  27.72 
 
 		 406 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5880  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  26.1 
 
 		 437 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5836  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  26.74 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1052  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  27.78 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1074  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  25 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3076  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 351 aa  46.2  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574821 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0125  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.14 
 
 		 343 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>