15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0322 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0322  mannosyltransferase OCH1-related enzyme  100 
 
 
317 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0270  mannosyltransferase OCH1-related enzyme  58.57 
 
 
343 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0187  hypothetical protein  55.03 
 
 
325 aa  332  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0318  hypothetical protein  36.1 
 
 
314 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0203  hypothetical protein  35.16 
 
 
311 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0266  hypothetical protein  40.48 
 
 
315 aa  175  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2764  hypothetical protein  30 
 
 
765 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419382  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2550  glycosyl transferase  22.61 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2901  hypothetical protein  24 
 
 
292 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000400572  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00816  hypothetical protein  31.52 
 
 
457 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1243  glycosyltransferase  29.9 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000811632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2395  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  25.23 
 
 
243 aa  45.8  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76016  membrane-bound alpha-1,6- mannosyltransferase Initiation-specific  27.78 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05461  capsule polysaccharide biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00130)  30.69 
 
 
399 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.584784  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  33.33 
 
 
712 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>