More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0120 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0131  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.72 
 
 		 550 aa  777    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3029  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.75 
 
 		 546 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0227  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.88 
 
 		 559 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2924  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.51 
 
 		 557 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2968  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.75 
 
 		 546 aa  734    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0144  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.51 
 
 		 555 aa  745    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.5 
 
 		 551 aa  815    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0160  acyl-CoA dehydrogenase  67.93 
 
 		 546 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0410  Acyl-CoA dehydrogenase  59.06 
 
 		 559 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1573  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.75 
 
 		 546 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3297  Acyl-CoA dehydrogenase  68.54 
 
 		 550 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0100  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  73.5 
 
 		 551 aa  816    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3298  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.93 
 
 		 546 aa  715    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3342  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.75 
 
 		 546 aa  734    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0173  Acyl-CoA dehydrogenase  60.11 
 
 		 561 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0120  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 564 aa  1149    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0215  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.88 
 
 		 559 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389081  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2938  acyl-CoA dehydrogenase-like  68.35 
 
 		 550 aa  775    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0116  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.31 
 
 		 550 aa  769    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0117  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.26 
 
 		 550 aa  751    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0107  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.62 
 
 		 550 aa  763    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4029  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.75 
 
 		 546 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0117  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.35 
 
 		 550 aa  775    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3955  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.93 
 
 		 546 aa  736    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3763  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.31 
 
 		 561 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.75018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0193  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.51 
 
 		 559 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0161  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  59.17 
 
 		 561 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3817  acyl-CoA dehydrogenase  58.83 
 
 		 548 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0204  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  60.93 
 
 		 553 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3316  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.41 
 
 		 553 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3639  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.41 
 
 		 553 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0121  putative oxidoreductase flavoprotein FAD  57.66 
 
 		 557 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2837  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.03 
 
 		 563 aa  515  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.218018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3582  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.08 
 
 		 563 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.54 
 
 		 550 aa  468  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.656776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0592  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.54 
 
 		 555 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0523  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.01 
 
 		 562 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2916  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.75 
 
 		 546 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.06 
 
 		 559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3764  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.81 
 
 		 549 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598594  normal  0.0554036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38660  acyl-CoA dehydrogenase  46.91 
 
 		 548 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4943  Acyl-CoA dehydrogenase-like  46.08 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12450  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.56 
 
 		 549 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1847  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.11 
 
 		 550 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440141  normal  0.493968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2958  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.69 
 
 		 545 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179146  hitchhiker  0.0000711281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0440  isovaleryl CoA dehydrogenase  49.14 
 
 		 544 aa  445  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000763646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1136  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.2 
 
 		 549 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04054  isovaleryl CoA dehydrogenase  45.88 
 
 		 541 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4431  isovaleryl CoA dehydrogenase  45.88 
 
 		 541 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4747  isovaleryl CoA dehydrogenase  45.88 
 
 		 541 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4338  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  45.9 
 
 		 549 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3826  isovaleryl CoA dehydrogenase  45.88 
 
 		 541 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.35 
 
 		 572 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04016  hypothetical protein  45.88 
 
 		 541 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4658  isovaleryl CoA dehydrogenase  45.69 
 
 		 541 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.61602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2251  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.9 
 
 		 534 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141599  normal  0.0458056 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.47 
 
 		 559 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447043 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3806  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.88 
 
 		 541 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.06 
 
 		 542 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108739  normal  0.35349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.91 
 
 		 550 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.303527  hitchhiker  0.00591476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.99 
 
 		 550 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.216664 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5703  isovaleryl CoA dehydrogenase  45.88 
 
 		 541 aa  438  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0640  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.63 
 
 		 559 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.91 
 
 		 550 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.938262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4717  isovaleryl CoA dehydrogenase  45.51 
 
 		 541 aa  435  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4724  isovaleryl CoA dehydrogenase (adaptive response to DNA-methylation damage)  45.54 
 
 		 547 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0365  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.15 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6703  acyl-CoA dehydrogenase  47.45 
 
 		 539 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3643  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.7 
 
 		 547 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1752  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.81 
 
 		 550 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.907741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3788  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.7 
 
 		 547 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2252  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.62 
 
 		 549 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3981  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.45 
 
 		 542 aa  432  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1269  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.64 
 
 		 551 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4257  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.68 
 
 		 559 aa  432  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4366  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.74 
 
 		 542 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128811  hitchhiker  0.00458691 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0687  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.89 
 
 		 547 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1782  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.38 
 
 		 543 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.121975  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1003  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46 
 
 		 551 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4655  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.2 
 
 		 540 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2827  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46.73 
 
 		 550 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952078  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0975  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46 
 
 		 551 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3525  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.83 
 
 		 549 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4774  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.2 
 
 		 540 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4738  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.01 
 
 		 540 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0993  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46 
 
 		 551 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4795  isovaleryl CoA dehydrogenase  45.82 
 
 		 540 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0438512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2427  Acyl-CoA dehydrogenase-like  45.97 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3025  acyl-CoA dehydrogenase-like  44.05 
 
 		 551 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285589  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4645  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.01 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09290  acyl-CoA dehydrogenase  46.28 
 
 		 571 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.142361  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2353  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.02 
 
 		 557 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5086  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.29 
 
 		 552 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.480357  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2819  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.27 
 
 		 543 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.708717  normal  0.776174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2564  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.13 
 
 		 579 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6225  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.72 
 
 		 529 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10686  acyl-CoA dehydrogenase fadE8  44.83 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0369  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.72 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3912  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.19 
 
 		 548 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000271467  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2281  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.23 
 
 		 547 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>