24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1108 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1108  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.594849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1655  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0636  transcriptional regulator, XRE family  55.71 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0370  hypothetical protein  59.38 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2865  transcriptional regulator, XRE family  58.46 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000773901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1528  transcriptional regulator, XRE family  61.19 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000508526  hitchhiker  0.00000000279301 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1465  transcriptional regulator  58.06 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1000  transcriptional regulator, XRE family  52.24 
 
 		 80 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000480499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3293  transcriptional regulator, XRE family  53.73 
 
 		 72 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2426  putative transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1546  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00936975  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0330  hypothetical protein  47.62 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0844  putative transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1909  putative transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386637 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1421  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3262  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.941421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0656  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0705  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.45038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2154  putative transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440989  hitchhiker  0.00829248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3714  putative transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 69 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1464  hypothetical protein  32.84 
 
 		 95 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>