19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0726 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0726  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 
82 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3206  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.78 
 
 
86 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0460524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5523  addiction module antidote family protein  38.16 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2652  hypothetical protein  38.03 
 
 
78 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3568  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  35.06 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.951393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.94 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  50 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6479  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.46 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5158  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  47.06 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.491967  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2938  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.46 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2127  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.62 
 
 
78 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114302  normal  0.153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1324  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40.35 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.179973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  33.33 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5298  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803296  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  32 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01196  helix-turn-helix protein, CopG  36.21 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  28.12 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.33 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>