26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2604 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2604  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  100 
 
 
183 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0132832  normal  0.179303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0164  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  51.09 
 
 
180 aa  210  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0834  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  50.6 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.369195  normal  0.0462432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0096  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  50.27 
 
 
181 aa  193  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3575  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  49.73 
 
 
183 aa  187  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2531  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  49.73 
 
 
183 aa  187  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1129  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  45.99 
 
 
183 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12051  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  44 
 
 
185 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.493042  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12041  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  43.43 
 
 
185 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11891  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  40.44 
 
 
194 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1109  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  43.1 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20885  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09721  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  43.09 
 
 
204 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1400  putative photosystem II oxygen-evolving complex 23K protein PsbP  43.02 
 
 
192 aa  142  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.21037  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10881  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  39.23 
 
 
186 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.327352 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1640  putative photosystem II oxygen-evolving complex 23K protein PsbP  41.85 
 
 
193 aa  141  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14821  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  38.1 
 
 
181 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.400899 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0650  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  36.56 
 
 
181 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0415879  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1038  photosystem II oxygen-evolving complex 23K protein  33.52 
 
 
195 aa  105  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.723321 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_118778  lumenal PsbP-like protein  34.78 
 
 
227 aa  104  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.130954  normal  0.114626 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44991  lumenal PsbP-like protein  36.36 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48359  predicted protein  29.19 
 
 
218 aa  72  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89292  lumenal PsbP-like protein  29.06 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.015352  normal  0.019871 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49743  predicted protein  37.9 
 
 
428 aa  55.1  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.733154  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_48109  oxygen evolving enhancer 2 of Photosystem II  26.23 
 
 
249 aa  54.7  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.124849  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30536  predicted protein  28.85 
 
 
218 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0726551 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24883  predicted protein  32.48 
 
 
853 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.543997  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>