16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1732 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1732  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 
183 aa  363  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.158456  normal  0.172881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1459  hypothetical protein  60.11 
 
 
200 aa  208  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000164986  hitchhiker  0.0000261489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0868  rod shape-determining protein MreD  55.08 
 
 
211 aa  206  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000649677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4168  rod shape-determining protein MreD  60.49 
 
 
181 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0147554  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4128  rod shape-determining protein MreD  60.25 
 
 
181 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3389  rod shape-determining protein MreD  51.69 
 
 
179 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0375737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1152  hypothetical protein  54.61 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.450592  hitchhiker  0.00560456 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0298  hypothetical protein  33.51 
 
 
215 aa  91.3  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18121  hypothetical protein  31.65 
 
 
183 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546148  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0151  hypothetical protein  29.69 
 
 
178 aa  51.6  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  27.4 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1713  hypothetical protein  27.46 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18301  hypothetical protein  30.22 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01811  hypothetical protein  26.56 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17461  hypothetical protein  23.53 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  26.87 
 
 
169 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>