49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1016 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1016  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 
80 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.110199 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0905  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.55 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02590  hypothetical protein  38.55 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000450519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4043  antitoxin MazE  38.55 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000354584  normal  0.435382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3090  antitoxin MazE  38.55 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2921  antitoxin MazE  38.55 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000204371  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0929  antitoxin MazE  38.55 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000171018  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3087  antitoxin MazE  38.55 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2927  antitoxin MazE  38.55 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02628  antitoxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system  38.55 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000289943  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0073  ChpR family protein  42.31 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261005  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0428  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3308  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.27 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.8 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1098  pemI family protein  36.25 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.5 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3899  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.02 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957207  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  38.1 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0264  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.74 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.1 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.35 
 
 
80 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.62 
 
 
80 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.46 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.62 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  35.8 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2889  transcriptional regulator, AbrB family  49.15 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0461439  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2509  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  49.15 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1108  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.59 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.68 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  34.88 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0694  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.71 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2886  PemI family protein  33.77 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2506  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.77 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  33.72 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.72 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  33.72 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3251  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.12 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.79659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  33.72 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3056  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3610  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  46.51 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429024  normal  0.027299 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4024  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.24 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.738162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.8 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2584  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.89 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7280  SpoVT/AbrB-like cell growth regulatory protein  37.25 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1478  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.06 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.749182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2066  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.91 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4270  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0902743  normal  0.118236 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0985  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  58.06 
 
 
77 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1367  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.36 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>