24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3197 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3197  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0772217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1194  PRC-barrel domain protein  47.7 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  29.94 
 
 		 347 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  29.38 
 
 		 563 aa  87.8  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0207  hypothetical protein  29.28 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05720  PRC-barrel domain protein  28.48 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.443895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3578  hypothetical protein  32.14 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0227988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1649  hypothetical protein  28.39 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0145454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2494  PRC-barrel domain protein  29.3 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  30.54 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  26.14 
 
 		 301 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0957  PRC-barrel domain protein  30.28 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1850  PRC-barrel domain-containing protein  28.66 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0886  hypothetical protein  25.9 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3061  hypothetical protein  29.75 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.488038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3233  hypothetical protein  25.62 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2588  PRC-barrel domain protein  27.27 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000158516  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0459  hypothetical protein  22.4 
 
 		 268 aa  45.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2986  hypothetical protein  26.71 
 
 		 327 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.394678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0398  hypothetical protein  28.57 
 
 		 349 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4099  PRC-barrel domain protein  25.81 
 
 		 315 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4138  PRC-barrel domain protein  25.81 
 
 		 318 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.359242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2564  hypothetical protein  25.6 
 
 		 274 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01360  hypothetical protein  21.74 
 
 		 381 aa  41.6  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>