14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7100 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7100  YD repeat protein  100 
 
 		 1065 aa  2185    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4144  YD repeat protein  33.79 
 
 		 1092 aa  156  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  0.283099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1049  YD repeat protein  28.14 
 
 		 1084 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1394  YD repeat protein  26.27 
 
 		 1129 aa  112  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2667  YD repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1152 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3730  YD repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1152 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0100146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3186  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1079 aa  98.2  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.187937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1097  YD repeat protein  27.27 
 
 		 1229 aa  86.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791752  unclonable  0.0000000000274764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2121  YD repeat protein  29.9 
 
 		 1837 aa  85.1  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873035  normal  0.943874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3006  YD repeat protein  25.09 
 
 		 1263 aa  72  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4387  hypothetical protein  47.46 
 
 		 1056 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95296  hitchhiker  0.00457818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4640  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1322 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.963654  normal  0.0174413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1352 aa  45.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  24.85 
 
 		 1489 aa  44.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>