17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5326 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5326  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 614 aa  1268    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4228  Lanthionine synthetase C family protein  27.01 
 
 		 661 aa  140  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1868  lanthionine synthetase C family protein  29.31 
 
 		 1080 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3979  Lanthionine synthetase C family protein  30.38 
 
 		 1117 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.027595 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0238  lanthionine synthetase C-like  24.52 
 
 		 1058 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0581031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5238  Lanthionine synthetase C family protein  31.25 
 
 		 1129 aa  84  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3486  Lanthionine synthetase C family protein  26.81 
 
 		 1093 aa  80.5  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0546748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1243  lanthionine synthetase (lantibiotic biosynthesis)  24.37 
 
 		 989 aa  80.1  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170162  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2006  Lanthionine synthetase C family protein  25.07 
 
 		 1078 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.517498  normal  0.231336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3047  Lanthionine synthetase C family protein  28.36 
 
 		 1088 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.318736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2897  Lanthionine synthetase C family protein  25.96 
 
 		 1126 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.965177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1979  Lanthionine synthetase C family protein  24.79 
 
 		 1078 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0783  Lanthionine synthetase C family protein  26.27 
 
 		 1074 aa  72.4  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265394  normal  0.258057 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1107  Lanthionine synthetase C family protein  23.55 
 
 		 1040 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0940946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4441  Lanthionine synthetase C family protein  27.04 
 
 		 959 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  22.18 
 
 		 713 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0349  lanthionine synthetase C family protein  29.01 
 
 		 996 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>