55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4671 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  63.27 
 
 		 512 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  100 
 
 		 499 aa  1019    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  65.24 
 
 		 510 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  62.01 
 
 		 497 aa  628  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  62.4 
 
 		 510 aa  623  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  58 
 
 		 487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  58.06 
 
 		 505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  56.91 
 
 		 487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.38 
 
 		 502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.33 
 
 		 475 aa  416  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.7 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  47.28 
 
 		 473 aa  395  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  45.8 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  48.82 
 
 		 464 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  44.59 
 
 		 475 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  43.48 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  48.95 
 
 		 465 aa  361  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.83 
 
 		 469 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  44.79 
 
 		 511 aa  360  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  40.92 
 
 		 462 aa  359  6e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  41.84 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  47.14 
 
 		 503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  48.31 
 
 		 475 aa  350  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  39.67 
 
 		 469 aa  345  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  40.99 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  40.3 
 
 		 460 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  45.6 
 
 		 480 aa  342  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.07 
 
 		 461 aa  339  8e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  47.14 
 
 		 461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  47.14 
 
 		 461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  47.14 
 
 		 461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  45.95 
 
 		 463 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  45.99 
 
 		 507 aa  335  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  46.22 
 
 		 463 aa  332  9e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.07 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  38.68 
 
 		 478 aa  330  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  44.21 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  45.48 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  37.47 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  19.48 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  21.79 
 
 		 304 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  24.52 
 
 		 334 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  24.52 
 
 		 334 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  23.92 
 
 		 334 aa  51.2  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  25.23 
 
 		 334 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.1 
 
 		 672 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  23.08 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.51 
 
 		 678 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  20.4 
 
 		 304 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  19.76 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  23.08 
 
 		 344 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  26.02 
 
 		 669 aa  43.5  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  21.47 
 
 		 351 aa  43.5  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  27.43 
 
 		 711 aa  43.5  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  23.48 
 
 		 345 aa  43.5  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>