10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0951 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0951  YhhN family protein  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  33.72 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  27.22 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  23.83 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  37.04 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  29.27 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  29.27 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  27.62 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  26.43 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  29.34 
 
 		 214 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>