18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2373 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2373  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  331  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  31.93 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  31.87 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  26.17 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  26.62 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  30.3 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0768  rod shape-determining protein MreD  29.03 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0581991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2660  rod shape-determining protein MreD  24.82 
 
 
193 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14220  hypothetical protein  28.12 
 
 
161 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000164387  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  35.82 
 
 
180 aa  44.7  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  24.77 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1732  rod shape-determining protein MreD  35.19 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.158456  normal  0.172881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  29.27 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2108  rod shape-determining protein MreD  26.49 
 
 
165 aa  42  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2396  rod shape-determining protein MreD  26.49 
 
 
165 aa  42  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  27.27 
 
 
164 aa  41.6  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1459  hypothetical protein  32 
 
 
200 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000164986  hitchhiker  0.0000261489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>