22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2288 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2288  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  407  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000373742  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1455  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  87  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2336  hypothetical protein  32.12 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0164  hypothetical protein  34.96 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4684  hypothetical protein  27.93 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000601642  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0307  hypothetical protein  34.62 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425006  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0624  hypothetical protein  28 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000644203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0610  hypothetical protein  27.43 
 
 
207 aa  61.6  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000967706  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0965  hypothetical protein  30.43 
 
 
248 aa  60.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00137731  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0357  hypothetical protein  46.43 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3032  hypothetical protein  31.96 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.574114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1219  hypothetical protein  31.58 
 
 
247 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3273  hypothetical protein  26.09 
 
 
349 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0026213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2833  hypothetical protein  27.12 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.14005e-16  hitchhiker  0.0000000000194487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0880  hypothetical protein  25.64 
 
 
299 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1791  hypothetical protein  23.04 
 
 
241 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00579846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1566  hypothetical protein  25.71 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0578  hypothetical protein  24.53 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.108637  normal  0.54693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2222  hypothetical protein  28.43 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000231366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0068  hypothetical protein  27.62 
 
 
239 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0691082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0788  hypothetical protein  31.03 
 
 
226 aa  44.7  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0315  hypothetical protein  25 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>