26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0562 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0562  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.916789  normal  0.708771 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0855  hypothetical protein  53.51 
 
 		 237 aa  207  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.110269  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  32.12 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0610  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.87 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.828743  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001985  protoporphyrinogen IX oxidase oxygen-independent HemG  30.77 
 
 		 175 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000384734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  28.46 
 
 		 175 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  22.81 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03990  Flavodoxin  25.78 
 
 		 159 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000376234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0198  protoporphyrinogen oxidase  27.42 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.53 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00463  protoporphyrinogen oxidase  25.56 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  23.3 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  21.64 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  29.41 
 
 		 335 aa  46.2  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  27.34 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  33.72 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2977  protoporphyrinogen oxidase  25.18 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  25.34 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  21.17 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  24.59 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  26.83 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1569  protoporphyrinogen oxidase  25.87 
 
 		 170 aa  42  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838772  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  20.44 
 
 		 173 aa  41.2  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.27 
 
 		 174 aa  41.2  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>