23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1102 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1102  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  828    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0398  hypothetical protein  27.52 
 
 		 410 aa  183  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0194907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1807  hypothetical protein  28.97 
 
 		 411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2775  hypothetical protein  27.72 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.717789  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2045  hypothetical protein  27.27 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107819  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1845  hypothetical protein  27.17 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1573  hypothetical protein  30.77 
 
 		 418 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0652  hypothetical protein  27.81 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.828544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1682  hypothetical protein  27.36 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246991  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1818  hypothetical protein  37.79 
 
 		 238 aa  135  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1819  hypothetical protein  26.49 
 
 		 208 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  32.63 
 
 		 749 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0862  LigA  27.15 
 
 		 544 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0866  LigA  27.15 
 
 		 542 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0814  LigA  30.91 
 
 		 557 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  37.68 
 
 		 873 aa  49.3  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  31.58 
 
 		 760 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  31.58 
 
 		 748 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  52.5 
 
 		 727 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  42.5 
 
 		 724 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  40 
 
 		 717 aa  43.1  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  40 
 
 		 717 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  42.5 
 
 		 732 aa  42.7  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>