19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0464 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0464  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  144  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09096  hypothetical protein  89.04 
 
 
73 aa  132  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5003  hypothetical protein  86.3 
 
 
73 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3979  hypothetical protein  80.82 
 
 
73 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0178163  normal  0.514914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5701  hypothetical protein  79.45 
 
 
73 aa  122  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_002950  PG0286  hypothetical protein  78.08 
 
 
85 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6891  hypothetical protein  78.08 
 
 
73 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.39159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1844  hypothetical protein  75.34 
 
 
73 aa  120  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2575  hypothetical protein  73.97 
 
 
73 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.924076 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0368  hypothetical protein  71.23 
 
 
73 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2554  hypothetical protein  73.24 
 
 
73 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1647  hypothetical protein  62.5 
 
 
75 aa  101  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0534  hypothetical protein  61.11 
 
 
75 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0471  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  98.2  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0177  hypothetical protein  59.72 
 
 
75 aa  98.2  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0653  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  95.9  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.75011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0493  hypothetical protein  54.79 
 
 
75 aa  94.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.947797  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0538  hypothetical protein  55.56 
 
 
75 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1055  hypothetical protein  38.3 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000280368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>