30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1133 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1133  diphthamide biosynthesis protein  100 
 
 
337 aa  669    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.45882 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1114  diphthamide biosynthesis protein  38.83 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1360  hypothetical protein  36.77 
 
 
303 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00886743 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0393  diphthamide biosynthesis protein  34.59 
 
 
303 aa  153  4e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0784701 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1734  hypothetical protein  36.01 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00147027 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0882  diphthamide biosynthesis protein  28.45 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1864  diphthamide biosynthesis protein  26.51 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1270  diphthamide biosynthesis protein  25.15 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1803  diphthamide biosynthesis protein  26.79 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3588  diphthamide biosynthesis protein  25.16 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1436  diphthamide biosynthesis protein  24.92 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2492  diphthamide biosynthesis protein  31.47 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0813  diphthamide biosynthesis protein  29.53 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1635  diphthamide biosynthesis protein  25.8 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2799  diphthamide biosynthesis protein  31.47 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.815597  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1634  diphthamide synthase subunit  26.35 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0218  hypothetical protein  23.05 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0484  diphthamide biosynthesis protein  26.49 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1190  diphthamide biosynthesis protein  25.24 
 
 
309 aa  67  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43090  predicted protein  23.91 
 
 
452 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0109024  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0764  diphthamide biosynthesis protein  25.47 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1488  diphthamide biosynthesis protein  25.47 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2168  diphthamide biosynthesis protein  27.05 
 
 
317 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2082  diphthamide biosynthesis protein  31.36 
 
 
315 aa  59.3  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1187  diphthamide biosynthesis protein  24.84 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.20081  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0905  diphthamide biosynthesis protein  24.52 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1846  diphthamide biosynthesis protein  28.74 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1563  diphthamide biosynthesis protein  22.26 
 
 
331 aa  50.4  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2613  diphthamide biosynthesis protein  23.84 
 
 
295 aa  49.7  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35812  predicted protein  22.98 
 
 
421 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0979008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>