13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1503 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1503  Abortive infection protein  100 
 
 		 233 aa  456  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0802465  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0757  abortive infection protein-like  51.11 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1404  Abortive infection protein  44.9 
 
 		 203 aa  155  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.352869 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0052  abortive infection protein  36.07 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.184729  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2513  abortive infection protein  35.23 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2361  abortive infection protein  30.6 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2930  abortive infection protein  34.83 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000197232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3435  Abortive infection protein  32.84 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3599  abortive infection protein  30.06 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  36.67 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2308  abortive infection protein  33.33 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0364  abortive infection protein  27.1 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.867808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0971  abortive infection protein  31.05 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>