14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0443 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0443  CRISPR-associated protein Cas5 family  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0308  hypothetical protein  58.94 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00170845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0570  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.33 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.519199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1867  CRISPR-associated Cas5 family protein  34.33 
 
 		 245 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3300  CRISPR-associated Cas5 family protein  33.02 
 
 		 245 aa  108  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1291  CRISPR-associated Cas5 family protein  36.47 
 
 		 255 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.599951  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5078  CRISPR-associated Cas5 family protein  32.5 
 
 		 238 aa  94.7  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1640  CRISPR-associated protein Cas5  41.3 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1389  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.55 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 1027 aa  62  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1002  CRISPR-associated Cas5 family protein  25.65 
 
 		 244 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2300  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.36 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0670  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.4 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0916  CRISPR-associated protein Cas5  28.48 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000397291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>