58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1061 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1061  possible periplasmic thioredoxin  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1249  thioredoxin domain-containing protein  62.81 
 
 
200 aa  265  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1124  thioredoxin domain-containing protein  62.81 
 
 
200 aa  264  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0616  thioredoxin domain-containing protein  61.31 
 
 
200 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.28635  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0711  thioredoxin domain-containing protein  54.7 
 
 
198 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0694  hypothetical protein  48.51 
 
 
199 aa  177  7e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1628  thioredoxin domain-containing protein  44.61 
 
 
201 aa  174  9e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.325697  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0059  thioredoxin domain-containing protein  44.55 
 
 
198 aa  160  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.457756  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1112  thioredoxin domain-containing protein  44 
 
 
197 aa  157  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0844  putative lipoprotein thiredoxin  29.15 
 
 
185 aa  101  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0882  Redoxin domain protein  27.45 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1341  putative lipoprotein  28.43 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0521  putative lipoprotein  27.86 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.747119  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1222  putative lipoprotein  28.43 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1311  transporter  30.25 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0971109  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1396  thiredoxin  30.25 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0500  thiredoxin  27.85 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.8 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.26 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30.61 
 
 
173 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.61 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.93 
 
 
174 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.24 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  36.92 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0260  Redoxin domain protein  36.84 
 
 
730 aa  47.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00568025  normal  0.921803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.33 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  30.77 
 
 
171 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  40.38 
 
 
170 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  23.66 
 
 
189 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  34.31 
 
 
158 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.88 
 
 
173 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.06 
 
 
185 aa  45.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  42.5 
 
 
174 aa  45.1  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
182 aa  44.7  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  33.8 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.48 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2173  Redoxin domain protein  29.91 
 
 
336 aa  43.5  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1212  conserved hypothetical lipoprotein  26.81 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1078  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.48 
 
 
383 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.899255  hitchhiker  0.00036256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.84 
 
 
380 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  25 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2106  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.51 
 
 
367 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  36.21 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  36.21 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  42.86 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  34.33 
 
 
173 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  34.33 
 
 
173 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  34.33 
 
 
173 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  34.33 
 
 
173 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  29.09 
 
 
188 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  34.33 
 
 
173 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  29.35 
 
 
171 aa  42  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  31.94 
 
 
173 aa  41.6  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  25.55 
 
 
194 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.99 
 
 
280 aa  41.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4433  redoxin domain-containing protein  22.02 
 
 
208 aa  41.2  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>