33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2779 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2779  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 153 aa  296  7e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.374177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1484  peptidase A24A prepilin type IV  55.3 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  34.33 
 
 		 250 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  35.04 
 
 		 260 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0731  peptidase A24A, prepilin type IV  31.43 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.465055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25.97 
 
 		 281 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  27.91 
 
 		 246 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  33.8 
 
 		 249 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.33 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  33.8 
 
 		 248 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.54 
 
 		 247 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.32 
 
 		 287 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0309  peptidase A24A prepilin type IV  28.48 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000294051  normal  0.397426 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.32 
 
 		 287 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08241  hypothetical protein  33.78 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.442263  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0192  hypothetical protein  33.78 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0474816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0809  peptidase A24A, prepilin type IV  32.76 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0038  peptidase A24A prepilin type IV  34.65 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  24.66 
 
 		 248 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1335  peptidase A24A, prepilin type IV  28.19 
 
 		 209 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.936907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  32.39 
 
 		 240 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  28.38 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  30.99 
 
 		 240 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  32.5 
 
 		 251 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  32.61 
 
 		 258 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  30.34 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.59 
 
 		 259 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  27.97 
 
 		 289 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  29.68 
 
 		 259 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1395  late competence protein comC  32.39 
 
 		 240 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3987  late competence protein comC  32.86 
 
 		 240 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1318  late competence protein comC  32.39 
 
 		 240 aa  40.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1219  late competence protein comC  32.39 
 
 		 240 aa  40.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>