19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1194 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1194  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
178 aa  345  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3197  PRC-barrel domain-containing protein  47.7 
 
 
184 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0772217  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  25.88 
 
 
563 aa  83.6  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1649  hypothetical protein  26 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0145454 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05720  PRC-barrel domain protein  27.03 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.443895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2494  PRC-barrel domain protein  24.65 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  24.55 
 
 
220 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  27.61 
 
 
301 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0957  PRC-barrel domain protein  24.83 
 
 
157 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0207  hypothetical protein  26.01 
 
 
248 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3578  hypothetical protein  28.12 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0227988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1850  PRC-barrel domain-containing protein  25.81 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3061  hypothetical protein  27.44 
 
 
268 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.488038  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  25.73 
 
 
347 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0465  hypothetical protein  28.03 
 
 
155 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000637262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3233  hypothetical protein  24.37 
 
 
250 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0459  hypothetical protein  28.81 
 
 
268 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0886  hypothetical protein  21.43 
 
 
259 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2589  hypothetical protein  22.83 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000783955  hitchhiker  0.00142136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>