More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5064 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_5064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
271 aa  552  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0351674  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3058  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  69.32 
 
 
272 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1657  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  57.42 
 
 
262 aa  308  9e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.81 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.627709  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.94 
 
 
288 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.75394  hitchhiker  0.000398592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.64 
 
 
282 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0741  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.9 
 
 
272 aa  298  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2171  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.29 
 
 
272 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0550079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2083  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.29 
 
 
272 aa  296  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
279 aa  292  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.08 
 
 
284 aa  292  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.190208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3131  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.65 
 
 
279 aa  292  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.044421  normal  0.0801716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0179  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.94 
 
 
264 aa  290  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.64 
 
 
276 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3448  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.9 
 
 
268 aa  289  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0222  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.25 
 
 
281 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3937  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.76 
 
 
282 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111733  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.43 
 
 
282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0051  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  51.36 
 
 
267 aa  285  7e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4058  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.12 
 
 
268 aa  284  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0431  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.12 
 
 
269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0611  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.61 
 
 
281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4380  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.73 
 
 
268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3934  hypothetical protein  56.64 
 
 
262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0146062  normal  0.728571 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.51 
 
 
262 aa  281  8.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.28 
 
 
276 aa  281  9e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0868707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.28 
 
 
291 aa  281  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.185416  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.28 
 
 
277 aa  281  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.917513  normal  0.103636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  53.15 
 
 
259 aa  280  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0180  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  52.12 
 
 
264 aa  280  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26134  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.86 
 
 
262 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.445364  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3176  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  55.86 
 
 
262 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2476  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.73 
 
 
270 aa  279  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0264852  normal  0.0112643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.05 
 
 
275 aa  278  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0066  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  55.08 
 
 
266 aa  278  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2344  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.76 
 
 
274 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.187833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1019  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.76 
 
 
274 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350664  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.36 
 
 
274 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0032  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.3 
 
 
277 aa  277  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.236001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2624  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  52.94 
 
 
279 aa  277  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.67 
 
 
275 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26472  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.38 
 
 
268 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000336187  normal  0.125543 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.54 
 
 
272 aa  274  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  52.36 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.12 
 
 
282 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.82 
 
 
261 aa  270  2e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.14 
 
 
282 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.78 
 
 
282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1270  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.02 
 
 
272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.57 
 
 
272 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4292  enoyl-acyl carrier protein reductase  52.87 
 
 
275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4661  enoyl-acyl carrier protein reductase  52.87 
 
 
275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1790  NADH dependent enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  49.8 
 
 
272 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00952782  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4143  enoyl-acyl carrier protein reductase  51.55 
 
 
275 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4769  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  51.75 
 
 
267 aa  266  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0134326  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.78 
 
 
273 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0631  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.82 
 
 
272 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4810  enoyl-acyl carrier protein reductase  52.49 
 
 
275 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.368185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
262 aa  265  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0591  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.43 
 
 
272 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152317  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0857  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.18 
 
 
275 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0535  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.21 
 
 
272 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0269  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  46.27 
 
 
280 aa  263  2e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  49.81 
 
 
286 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0682  enoyl-acyl carrier protein reductase  49.44 
 
 
286 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0811  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.64 
 
 
266 aa  260  2e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0420  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.03 
 
 
272 aa  259  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1211  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.22 
 
 
272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1312  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
272 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0428  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.64 
 
 
272 aa  258  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0657  enoyl-acyl-carrier-protein reductase  46.42 
 
 
275 aa  257  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.45449  normal  0.282453 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
256 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1140  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.84 
 
 
273 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1126  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
256 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0465054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1139  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
256 aa  255  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000599586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1119  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
256 aa  255  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1113  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
256 aa  255  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000710304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1300  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
256 aa  255  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000387005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1272  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
256 aa  255  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00654977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1232  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
256 aa  255  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1377  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
256 aa  255  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0829066  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
292 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1339  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
256 aa  254  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4070  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
256 aa  254  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.100281  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.89 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.83 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00175995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.44 
 
 
282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.98 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.34 
 
 
256 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.95 
 
 
256 aa  251  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.486877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
256 aa  251  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.905975  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5525  enoyl-acyl carrier protein reductase  49.03 
 
 
274 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2468  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
277 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1006  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  48.43 
 
 
254 aa  250  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
261 aa  249  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0396  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.03 
 
 
272 aa  248  5e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.632907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2044  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH-dependent)  48.81 
 
 
255 aa  248  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7605800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2204  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.97 
 
 
262 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1636  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.03 
 
 
258 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
254 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.972162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>