20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0478 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6189  hypothetical protein  77.92 
 
 
396 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4925  hypothetical protein  77.6 
 
 
396 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0193  hypothetical protein  83.25 
 
 
398 aa  677    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3811  hypothetical protein  80.1 
 
 
396 aa  651    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0772  hypothetical protein  85.31 
 
 
403 aa  678    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.447224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2857  hypothetical protein  84.28 
 
 
403 aa  674    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0478  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  819    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1047  hypothetical protein  73.9 
 
 
398 aa  612  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.947339  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2348  hypothetical protein  75.79 
 
 
398 aa  607  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0570  hypothetical protein  75.85 
 
 
398 aa  607  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4578  hypothetical protein  74.81 
 
 
397 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4026  hypothetical protein  73.74 
 
 
397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2780  hypothetical protein  74.08 
 
 
397 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1467  hypothetical protein  73.49 
 
 
402 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1544  hypothetical protein  51.88 
 
 
402 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.885517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0608  two component transcriptional regulator  93.33 
 
 
393 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4145  hypothetical protein  73.96 
 
 
235 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0841  hypothetical protein  77.78 
 
 
167 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  hitchhiker  0.00403969 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4137  hypothetical protein  64.33 
 
 
172 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0283  hypothetical protein  24.33 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>