24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3812 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3812  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  100 
 
 		 449 aa  894    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.458595 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0915  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  79.58 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.994799  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0316  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  45.02 
 
 		 324 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.157396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0933  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  46.03 
 
 		 330 aa  201  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1989  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  39.78 
 
 		 332 aa  199  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.48391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4240  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  42.49 
 
 		 328 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0806  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  42.72 
 
 		 367 aa  189  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3826  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  41.24 
 
 		 319 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.782464  hitchhiker  0.00621555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2589  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  41.54 
 
 		 330 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.598353  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1356  hypothetical protein  36.86 
 
 		 321 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.278075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0660  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  27.17 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0318  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  27.41 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1482  Cmr4 family CRISPR-associated RAMP protein  28.41 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.541255  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0962  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein  25.86 
 
 		 264 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.60167  normal  0.960375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2295  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  28.57 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  44 
 
 		 959 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15130  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  28.68 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1949  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  27.97 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0784  protein of unknown function DUF324  27 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1028  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  27.04 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1660  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  25.76 
 
 		 276 aa  53.5  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1315  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  27.43 
 
 		 327 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  35.35 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1912  Allergen V5/Tpx-1 related  29.41 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>