34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1569 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  41.77 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  45.07 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  40 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  36.25 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  40 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  35.06 
 
 
80 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  33.77 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  38.75 
 
 
90 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  40.85 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  38.16 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  38.89 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  36.49 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  40.28 
 
 
103 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  38.24 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  38.03 
 
 
88 aa  52  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  38.89 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  39.13 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  41.67 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1993  hypothetical protein  34.72 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558528  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1000  hypothetical protein  34.72 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0674  hypothetical protein  36.11 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  36.36 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  30.99 
 
 
84 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.62 
 
 
114 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1819  hypothetical protein  39.68 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1097  hypothetical protein  29.87 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0617  hypothetical protein  35.82 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5000  hypothetical protein  32.79 
 
 
74 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0903  hypothetical protein  27.69 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50164  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0662  hypothetical protein  30.3 
 
 
117 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.6245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>