14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8935 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8935  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  355  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00543582  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4646  hypothetical protein  43.54 
 
 
174 aa  111  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0250734  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4198  hypothetical protein  38.07 
 
 
174 aa  94.4  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912124  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5077  hypothetical protein  32.73 
 
 
168 aa  91.3  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4703  hypothetical protein  36.11 
 
 
168 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0124469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3101  hypothetical protein  31.29 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148369  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0122  hypothetical protein  33.54 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3237  hypothetical protein  33.8 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0152  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4211  hypothetical protein  38.1 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26760  hypothetical protein  28.65 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14308  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4209  hypothetical protein  36.8 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1549  hypothetical protein  32.81 
 
 
194 aa  61.6  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0808591  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1948  hypothetical protein  27.13 
 
 
132 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.841214  normal  0.0350761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>