13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7936 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7936  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4226  hypothetical protein  80.77 
 
 
50 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2466  hypothetical protein  69.23 
 
 
52 aa  80.9  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0349233  hitchhiker  0.0000612966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1520  hypothetical protein  67.31 
 
 
52 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.658158  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1767  hypothetical protein  67.31 
 
 
59 aa  77  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1594  hypothetical protein  69.23 
 
 
49 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.114976 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11420  hypothetical protein  66 
 
 
52 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.929313  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4381  hypothetical protein  62.75 
 
 
51 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1839  hypothetical protein  65.31 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0936  hypothetical protein  67.31 
 
 
51 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4115  hypothetical protein  62.75 
 
 
55 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68855  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1184  hypothetical protein  63.46 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.129862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3734  hypothetical protein  62.75 
 
 
55 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>