10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6577 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6577  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1172    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2164  hypothetical protein  39.89 
 
 		 291 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.107733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2319  hypothetical protein  39.89 
 
 		 291 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6995  hypothetical protein  28.54 
 
 		 587 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  0.817264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6581  hypothetical protein  27.57 
 
 		 558 aa  97.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  28.03 
 
 		 291 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  31.34 
 
 		 268 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  29.5 
 
 		 233 aa  48.5  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  24.29 
 
 		 273 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  24.29 
 
 		 273 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>