15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5577 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5577  von Willebrand factor type A  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3401  hypothetical protein  41.18 
 
 
209 aa  142  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0842  hypothetical protein  40.34 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3145  hypothetical protein  37.61 
 
 
223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1718  von Willebrand factor type A  37.56 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20900  hypothetical protein  41.32 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0530  hypothetical protein  39.52 
 
 
200 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000151796  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1750  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.46 
 
 
231 aa  123  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.161961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0193  hypothetical protein  37.85 
 
 
217 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0762  von Willebrand factor type A  38.29 
 
 
233 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.915721  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0724  hypothetical protein  34.95 
 
 
240 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255555  normal  0.0372103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1694  hypothetical protein  41.82 
 
 
122 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.299884  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5886  hypothetical protein  35.19 
 
 
110 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  hitchhiker  0.00718137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  32.21 
 
 
547 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3999  Capsule synthesis protein, CapA  28.69 
 
 
449 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0396426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>