16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3237 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3237  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  340  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5077  hypothetical protein  47.93 
 
 
168 aa  160  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4703  hypothetical protein  41.94 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0124469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3101  hypothetical protein  35.85 
 
 
169 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148369  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4646  hypothetical protein  36.69 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0250734  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0122  hypothetical protein  35.62 
 
 
167 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4198  hypothetical protein  37.96 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912124  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0152  hypothetical protein  32.64 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8935  hypothetical protein  33.58 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00543582  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4211  hypothetical protein  31.82 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26760  hypothetical protein  29.87 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14308  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1549  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0808591  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4209  hypothetical protein  29.01 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4282  hypothetical protein  28.68 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4514  hypothetical protein  24.68 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.317582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1948  hypothetical protein  35.8 
 
 
132 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.841214  normal  0.0350761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>