21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2158 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2158  secreted protein  100 
 
 		 477 aa  943    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37220  hypothetical protein  33.76 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4552  hypothetical protein  31 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.420738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3507  hypothetical protein  33.86 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4940  putative secreted protein  29.91 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0200  hypothetical protein  27.19 
 
 		 439 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4394  hypothetical protein  30.38 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0542  hypothetical protein  28.34 
 
 		 439 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0554  hypothetical protein  28.34 
 
 		 439 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.656823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0532  hypothetical protein  28.34 
 
 		 439 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2814  hypothetical protein  28.12 
 
 		 558 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.856062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3753  hypothetical protein  29.79 
 
 		 445 aa  90.1  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.18885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2422  putative secreted protein  30.15 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376537  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0705  hypothetical protein  29.32 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10417  hypothetical protein  25.94 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000130762  normal  0.910848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2229  hypothetical protein  28.7 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239901  hitchhiker  0.0000156459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4401  hypothetical protein  29.27 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0879683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2458  hypothetical protein  31.82 
 
 		 519 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00115564  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3061  hypothetical protein  34.01 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000314262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0185  hypothetical protein  26.83 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2465  hypothetical protein  26.74 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>